Před začátkem kariéry herce pracoval Václav Kotek jako kulisák. Členem souboru Cimrmanů se stal v roce 1973, a zahrál si celkem ve dvanácti dramatech divadla. Ve hře Vyšetřování ztráty třídní knihy jeho postavou byl zemský školní rada, v Hospodě Na mýtince si zahrál inspektora Trachtu. Hrál také ve Vraždě v salonním coupé, Němém Bobeši, Dlouhém, Širokém a Krátkozrakém, Poseli z Liptákova, Lijavci, Blaníku, Záskoku, Švestce, ve hře Afrika a České nebe. Zahrál si i ve filmech Nejistá sezona a Rozpuštěný a vypuštěný.

Synem Kotka je populární český herec Vojtěch Kotek.

V roce 2007 Václav Kotek vedl horolezeckou výpravu na ruský Altaj, kde úspěšně dobyli horu vysokou 3610 metrů. Vrchol pak pojmenovali „Hora Járy Cimrmana“.