Při nedostatku vitamínu K2 nedochází k aktivaci bílkovin, které ukládají vápník na správných místech v organizmu. Následkem může být zvýšené ukládání vápníku v měkkých tkáních a cévách, kde jednoznačně škodí. Naopak hrozí nedostatečné ukládání vápníku v kostech, tím i vyšší riziko vzniku osteoporózy.